IF803 - Introdução à Biologia Molecular Computacional
Período 2007/2
 

Programação de Aulas

Aula

Data

Assunto 

Horas

1

02/out

Introdução à Biologia Molecular Computacional

02

2

04/out

História Recente da área e problemas típicos

04

3

09/out

Estrutura do DNA e das proteínas, Transcrição e Tradução

06

4

11/out

Alinhamento Global de Duas Seqüências

08

5

16/out

Alinhamentos Local e Semi-Global Duas Seqüências (Divulgação do projeto 1)

10

6

18/out

Estruturas de Dados para Inferência de Motifs

12

7

23/out

MelhorandoAlinhamentosLocais

14

8

25/out

MelhorandoAlinhamentosLocais - Detalhes da operação do algoritmo

16

9

06/nov

Multiple Sequence Alignment

18

10

08/nov

Métodos para Identificação de Motifs

20

11

13/nov

HMMs

22

--

15/nov

Feriado  - Proclamação da República

22

12

20/nov

1o. Exercício Escolar - Assunto = Caps. 1 e 3 (até pág. 79) do livro de Setubal e Meidanis

24

13

22/nov

HMMs (continuação)

26

14

27/nov

NCBI, BLAST, CDD, Etc...

28

15

29/nov

Rearranjo de Genomas

30

16

04/dez

Rearranjo de Genomas (continuação)

32

17

06/dez

Rearranjo de Genomas (continuação)

34

18

11/dez

Clusterização de Dados de Micro-array

36

19

13/dez

Inferência de Redes Reguladoras a partir de Dados de Micro-array

38

20

18/dez

Algoritmos para Bi-clustering:  Two-way e Iterative Signature

40

21

20/dez

Algoritmos para Bi-clustering:  SAMBA

42

--

25/dez

Não haverá aulas  -  Recesso Natalino   (23/dez a 01/jan)

42

--

27/dez

Não haverá aulas  -  Recesso Natalino   (23/dez a 01/jan)

42

22

03/jan

Combinatorial Pattern Matching e o Algoritmo BLAST 

44

23

08/jan

Introdução à Reconstrução de Árvores Filogenéticas

46

24

10/jan

Reconstrução de Árvores Filogenéticas - Algoritmos BPA e GRAPPA

48

25

11/jan

Predição de Estrutura Secundária e Super-secundária de Proteínas

50

26

15/jan

Geração de Bancos de dados de Interação e Predição de interações domínio-domínio usando interações de proteínas

52

27

17/jan

Predição de interações domínio-domínio e domínio-peptídeo

54

28

22/jan

Segunda prova

56

29

24/jan

Associando dados moleculares a doenças

58

30

31/jan

PROVA FINAL

60