FAAz - Fragment Assembler Analyzer. Fragment Assembler Analyzer é uma ferramenta que compara os consensos resultantes dos montadores PHRAP e CAP3. O PRHAP e CAP3 são ferramentas que realizam alinhamentos de sequencias gerando outras maiores, com base na semelhança dos fragmentos de entrada. O principal objetivo do FAAz é permitir uma melhor visualização detalhada de cada montagem, comparando-as as saídas de cada montador e realçando suas diferenças. E a partir destas diferenças identificar possíveis erros de montagem. Ou seja, destacar fragmentos que o PHRAP juntou e o CAP não, por exemplo. De forma resumida, o FAAz exibe saídas gráficas com resultados qualitativos e quantitativos das diferenças entre as montagens obtidas pelos montadores.