Introdução à
Bioinformática
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Descrição: este curso tem como objetivo introduzir o tópico de bioinformática a alunos do curso de computação. Mais especificamente, o foco será sobre as técnicas de aprendizado máquina (inteligência artificial) aplicadas a problemas de genômica funcional (por exemplo, a partir de dados de expressão gênica, identificar a função de genes desconhecidos, diagnosticar tumores cancerígenos, descobrir novos sub-tipos doenças etc.) e predição de estrutura de proteínas. Também, serão revisados alguns métodos para análise de dados de seqüências, tanto para a montagem de genomas (por exemplo, algoritmos de alinhamento) quanto para o estudo da evolução de genomas (algoritmos de filogenia). |
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Bibliografia: |
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· Baldi, P. e Brunak, S. (2001). Bioinformatics: the Machine Learning Approach. MIT Press. |
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· de Souto, M. C. P., Lorena, A. C., Delbem, A. C. B. e de Carvalho, A. C. P. L. F. (2003). III Jornada de Mini-Curso de Inteligência Artificial – Livro Texto, capítulo Técnicas de Aprendizado de Máquina para Problemas de Biologia Molecular, pp. 103-152. Editora SBC. |
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Mitchell,
T. (1997). Machine Learning. McGraw Hill, New York. |
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· Monard, M. C. e Baranauskas, J. A. (2003). Sistemas Inteligentes: Fundamentos e Aplicações, capítulo Conceitos sobre Aprendizado de Máquina, pp. 89–114. Editora Manole. |
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· Setúbal, J. C. e Meidanis, J. (1997). Introduction to Computational Molecular Biology. PWS Publishing Company. |
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Silva, F. H. (2001). Apostila -
curso de biologia molecular. INBIO - I Escola Brasileira de Inteligência
Artificial e Bioinformática, ICMC-USP, São Carlos. http://www.icmc.usp.br/~inbio/material/Apostila_Inbio_Biomol.pdf. |
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